Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2Q96Q42 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ALS2Q96Q42 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2Q96Q42 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms