Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNT1Q96Q11 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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