Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC85AQ96PX6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85AQ96PX6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms