Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGAP1Q96PV0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms