Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC7Q96NW7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms