Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms