Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF4Q96M43 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF4Q96M43 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms