Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms