Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms