Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PHACTR3Q96KR7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms