Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERAC1Q96JX3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERAC1Q96JX3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms