Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHAMP1Q96JM3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms