Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VCPIP1Q96JH7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms