Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EAF1Q96JC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms