Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms