Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPDL1Q96EA4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPDL1Q96EA4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms