Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf8Q96DM3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf8Q96DM3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms