Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDF1Q96CC6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDF1Q96CC6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms