Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms