Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG2BQ96BY7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms