Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L1Q96BA8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L1Q96BA8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms