Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKL1Q969V6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms