Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms