Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DPF3Q92784 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms