Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNRQ92752 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNRQ92752 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNRQ92752 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNRQ92752 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNRQ92752 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNRQ92752 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNRQ92752 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNRQ92752 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNRQ92752 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNRQ92752 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNRQ92752 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNRQ92752 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNRQ92752 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNRQ92752 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNRQ92752 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNRQ92752 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNRQ92752 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms