Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCSTNQ92542 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCSTNQ92542 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms