Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms