Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
C1orf54Q8WWF1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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