Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms