Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C15orf40Q8WUR7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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