Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELQQ8TDG4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms