Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPTSSBQ8NFR3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms