Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC63Q8NA47 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC63Q8NA47 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms