Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms