Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD12Q8N8I0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD12Q8N8I0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms