Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms