Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN19Q8N6F1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CLDN19Q8N6F1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CLDN19Q8N6F1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CLDN19Q8N6F1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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CLDN19Q8N6F1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CLDN19Q8N6F1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CLDN19Q8N6F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CLDN19Q8N6F1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN19Q8N6F1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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