Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L2Q8N4U5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L2Q8N4U5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms