Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC71Q8N4P6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms