Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC2Q8N158 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC2Q8N158 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms