Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms