Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9A9Q8IVB4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms