Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM139Q8IV31 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms