Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX29P2Q8IUI4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms