Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM50Q86XT4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM50Q86XT4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms