Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASSF3Q86WH2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms