Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMB4Q86W47 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms