Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PBRM1Q86U86 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms