Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY3Q7L099 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY3Q7L099 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms