Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KNDC1Q76NI1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KNDC1Q76NI1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms